Waspadai Ancaman Varian Virus Covid-19 Epsilon, Lebih Ganas dari Delta?

on

Hidupgaya – Belum usai ancaman varian virus Delta dengan statusnya sebagai Variant of Concern, kini ilmuwan mengungkap varian virus corona Epsilon yang patut menjadi perhatian. Tiga mutasi pada protein lonjakan virus corona Epsilon meredam potensi penetralan antibodi yang diinduksi oleh vaksin saat ini atau infeksi COVID di masa lalu.

Mutasi itu membuat Epsilon sebagai varian coronavirus yang menjadi perhatian, terkait kemampuannya untuk benar-benar menghindari antibodi monoklonal spesifik yang digunakan di klinik dan mengurangi efektivitas antibodi dari plasma orang yang divaksinasi.

Guna lebih memahami strategi pelarian kekebalan, para ilmuwan memvisualisasikan mesin infeksi varian ini untuk melihat apa yang berbeda dari konfigurasi asli virus corona, dan apa implikasi dari perubahan ini.

Projek internasional ini dipimpin oleh laboratorium David Veesler di Departemen Biokimia di Universitas Washington di Seattle dan oleh Luca Piccoli dan Davide Corti dari Vir Biotechnology. Selama beberapa tahun, laboratorium Veesler dan kolaboratornya telah mengeksplorasi formasi molekuler dan mekanisme infeksi virus corona mirip SARS. Mereka juga memeriksa bagaimana antibodi berusaha memblokir mekanisme infeksi, dan bagaimana varian muncul dengan mekanisme penghindaran baru.

Data terbaru menunjukkan bahwa varian Epsilon bergantung pada strategi pelarian netralisasi tidak langsung dan tidak biasa, menurut studi yang dipublikasikan sebagai makalah rilis pertama di jurnal Science.

Analisis jam molekuler menghitung waktu kemunculan pendahulu varian Epsilon hingga Mei 2020 di California. Pada musim panas 2020, varian ini telah menyimpang ke dalam garis keturunan B.1.427/B.1.429. Kasus COVID dari variannya meningkat dengan cepat, dan variannya segera menyebar luas di Amerika Serikat. Sekarang telah dilaporkan di setidaknya 34 negara lain.

Untuk mempelajari lebih lanjut tentang karakteristik varian Epsilon, para peneliti menguji ketahanan plasma varian Epsilon dari orang yang terpapar virus, serta orang yang divaksinasi. Potensi penetralan plasma terhadap varian Epsilon yang menjadi perhatian (Variant of Concern) berkurang sekitar 2 hingga 3,5 kali lipat.

Seperti SARS-CoV-2 asli, varian ini menginfeksi sel target melalui glikoprotein lonjakan, yaitu struktur yang memahkotai permukaan virus. Para peneliti menemukan bahwa mutasi Epsilon bertanggung jawab untuk penataan ulang di area kritis dari glikoprotein lonjakan. Studi kriomikroskopi elektron menunjukkan perubahan struktural di area ini.

Memvisualisasikan mutasi ini membantu menjelaskan mengapa antibodi mengalami kesulitan mengikat glikoprotein lonjakan.

Salah satu dari tiga mutasi pada varian Epsilon mempengaruhi domain pengikatan reseptor pada glikoprotein lonjakan. Mutasi ini mengurangi aktivitas penetralan 14 dari 34 antibodi penetral yang spesifik untuk domain tersebut, termasuk antibodi stadium klinis.

Dua lainnya dari tiga mutasi dalam varian mempengaruhi domain N-terminal pada glikoprotein lonjakan. Para peneliti menggunakan spektrometri massa dan analisis struktural untuk menemukan bahwa bagian dari domain terminal-N virus corona dirombak oleh mutasi ini.

Situs pembelahan peptida sinyal digeser di supersite antigenik NTD, dan ikatan disulfida baru terbentuk. Hal ini mengakibatkan hilangnya netralisasi total sebesar 10 dari 10 antibodi yang diuji khusus untuk domain terminal-N dalam glikoprotein lonjakan.

Ilmuwan percaya bahwa mengungkap mekanisme penghindaran kekebalan, seperti mekanisme yang baru ditemukan ini berdasarkan modifikasi peptida sinyal, sama pentingnya dengan pengawasan varian melalui sekuensing RNA. Upaya semacam jika dilakukan bersama-sama dapat membantu keberhasilan melawan pandemi yang sedang berlangsung. (sumber: berandasehat.id)

Tinggalkan Balasan

Isikan data di bawah atau klik salah satu ikon untuk log in:

Logo WordPress.com

You are commenting using your WordPress.com account. Logout /  Ubah )

Foto Google

You are commenting using your Google account. Logout /  Ubah )

Gambar Twitter

You are commenting using your Twitter account. Logout /  Ubah )

Foto Facebook

You are commenting using your Facebook account. Logout /  Ubah )

Connecting to %s